國立臺灣大學地質科學系成立於日治時代，多數館藏承接至臺北帝大時代，資料量至為龐大多樣，包括礦物標本約500件、岩石約450件、化石約2300件、礦物寶石約數十件等，深具資料保存維護、研究、教育等功能。在眾多館藏之中，地質科學系首先進行礦物標本之數位化，以本土礦物為主，國外礦物為輔，內容包括：瑞芳鎮金瓜石所產的呂宋礦（Luzonite）、硫砷銅礦（Enargite）、重晶石（Barite）、黃鐵礦（Pyrite）、臭蔥石（Scorodite）；花蓮所產的冰長石（Adularia）、石榴子石（Garnet）、閃玉（Nephrite）、陽起石（Actinolite）、豐田的透輝石（Diopside）、蠟光玉（Waxy nephrite）、鈣鋁榴石（Grossular）；大南澳的微斜長石（Microcline）、正長石（Orthoclase）；以及北投產的北投石（Hokutolite）。外國礦物則包括：澳洲的磁黃鐵礦（Pyrrhotite）、菱鐵礦（Siderite）、白鉛礦（Cerussite）；與美國紐澤西州的鈉沸石（Natrolite）、針鈉鈣石（Pectolite）等。